药学部是承担医院药品采购、供应、调配，自制制剂研发、配制，药学管理、药事服务及贯彻执行药政法规、制度为一体的综合性药学技术与管理部门。药学部设置中心西成药房、中药房，西成药仓库、中药饮片仓库，制剂中心、煎药中心、静配中心、临床药学室、药学门诊、药品质量监控室等多个专业部门。是湖北省中药药事管理质量控制中心成员单位、荆州市中药药事管理质量控制中心以及荆州市中医药学会中药专业委员会牵头单位，负责荆州市制剂研发生产教育基地和医院药事管理与药物治疗学委员会日常管理运行工作。负责王世华全国老药工传承工作室建设工作。

近年来，医院加大药学学科的建设和投入。新建现代化中药房、中心药房。为提高药学工作效率和服务质量，增加中药饮片智能调剂和西成药调剂等先进设备，安装药品运输物流智能导向系统。投入近1000万元购置制剂生产与检验、中药煎煮、处方前置审核系统等软硬件设备。

医院高度重视药学部人才队伍建设。现有药学专业技术人员89人，其中中药专业技术人员58人；主任药师2人，副主任药师6人，中级职称41人；硕士研究生11人。拥有全国老药工传承工作指导老师1人，全国中药特色技术传承人才4人，荆州市首批中医药“师带徒”指导老师4人，国家中医药管理局第四期中药资源管理人才研修班优秀学员1人。2名药师入选医院第一批“杏林托举”人才培养对象。近5年派遣药学人员进修10余人次，支持攻读研究生学历2人次。

药学部不断开展中药科研创新与成果转化。医院出台“双百万”工程支持中药制剂研发推广，现有取得批准文号的中药制剂67个，2021年以来先后有3个中药制剂通过湖北省药监局批准取得制剂批准文号，3个制剂正在研究阶段，预计2025年取得批准文号。顺利完成全国第四次中药资源普查（沙市区）工作。2021年以来，共承担科研课题5项，发表论文10余篇。